Pythonで時系列変化する散布図+棒グラフ を同時に描きたい（コードつき）

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この記事を読んでわかること

こういう with 棒グラフを描くスクリプト


左はサンプル点、右は重み
赤はground truth. 薄い青は若いindex番号, 濃い青は大きいindex番号
サンプル点と重みの色には対応関係がある

こんなグラフは何の役に立つのだろう？？

役に立つのはこんな状況かな？

  • 散布図で情報を表現したいとき。つまり、空間座標の情報が意味を持つ時
  • 散布図が時間と共に変化していくとき。
  • 散布図の変化はなんらかのパラメタに影響を受けているとき。

思いつく例だと、遺伝アルゴリズムの可視化に使えると思う。

コード

技術スタック

散布図の点を連続値で色塗りする

matplotplibのscatterメソッドの標準装備。

Python でデータサイエンス
 
matplotlib で散布図 (Scatter plot) を描く
https://pythondatascience.plavox.info/matplotlib/散布図
本ページでは、Python のグラフ作成パッケージ Matplotlib を用いて散布図 (Scatter plot) を描く方法について紹介します。 matplotlib.pyplot.scatter の概要 matp …

パッケージのscatterにはこの機能がなかった。残念！

seaborn.pydata.org
 
seaborn.scatterplot — seaborn 0.11.1 documentation
https://seaborn.pydata.org/generated/seaborn.scatterplot.html

散布図でデフォルトと別の色を持つ点を描写したい

要するに図の赤点を描写したい。このために、プロット命令を複数実行する、と考えればいい。

プロット命令を同じレイヤーに対して複数実行すると、レイヤーに上書きされるからだ。

Pythonで複数の散布図を重ねる方法を現役エンジニアが解説【初心者向け】

中央にタイトルを記載する

sodocumentation.net
 
matplotlib - Multiple Plots | matplotlib Tutorial
https://sodocumentation.net/matplotlib/topic/3279/multiple-plots
matplotlib documentation: Multiple Plots

numpyのスライシングを可変にする

tensor中の最小値・最大値を求めたい。しかも、３次元目のxだけを指定して最小・最大を求めたい。

ハードコードで多次元配列にアクセスする手段もあるが・・・関数化して処理を使いまわししたかった。

そこで、こんなやり方を発見

Stack Overflow
How to access/reference specific dimensions of a Numpy array
https://stackoverflow.com/questions/49977932/how-to-access-reference-specific-dimensions-of-a-numpy-array
Suppose I have a 3-D array x, I know I could do:x = ybut what if x is a N-D array and I want to put an index (ind) in its M-th dimension.I tried to use numpy.take like x.take(ind, ax...

barの色を連続値にする

棒グラフのbarメソッドには、色を連続値で表示するための自動計算機能がない。棒グラフってもともと離散値を表示するためのものだから、とても当たり前のこと。

Stack Overflow
 
pyplot/matplotlib Bar chart with fill color depending on value
https://stackoverflow.com/questions/31313606/pyplot-matplotlib-bar-chart-with-fill-color-depending-on-value
I want to produce in python with matplotlib/pyplota bar chart with a fill depending on the value.legend color barwhile keeping module dependencies at a minimum.Is there something simpler tha...

barメソッドにはリストで色を指定して与える必要がある。でも、ぼくはどうしても連続値で色付けしたかった。

そこで、色コードを生成して、色コードをリストに詰める。

Stack Overflow
Color map to shades of blue - python
https://stackoverflow.com/questions/52758070/color-map-to-shades-of-blue-python/52758206
I have the following (example) code:import numpy as npimport matplotlib.pyplot as pltimport matplotlib as mpln_lines = 5x = np.linspace(0, 10, 100)y = np.sin(x + np.pi * np.linspac...

この記事を書こうとおもったきっかけ

Pythonできれいな散布図+イテレーションごとの変化過程+ラベル表示 を描くために？（コードつき）

前回はこんなグラフを作った。前回のグラフではまた不足になってしまった。

さらに重みの表示が必要になった。なぜなら、は重みの方向に進んでいくから。

重みの表示をすると、サンプル点と重みの対応関係をなんらかの情報を表示したくなる。その結果、カラーバーを使うことにしてみた。

カラーバーでは厳密にサンプル点と重みの対応関係を得ることができないが・・それでもないよりはマシ。

グラフが進化していくね（にっこり）

Programming and researchmatplotlib,Python,Visualization

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